碱性亮氨酸拉链 (bZIP) 等转录因子 (TF) 在各种植物生物调节(包括胁迫反应)中发挥着至关重要的作用。然而，它们在悬钩子属物种中的存在受到的关注有限，特别是关于悬钩子属 中 bZIP 基团 S1 和 C 的功能和相互作用 。当前的挑战在于加深我们对非模型植物中这些 bZIP 网络的了解，这可以为育种策略提供信息并提高作物的恢复力。
2024年2月，Fruit Research发表了题为“黑树莓中C/S1基本亮氨酸拉链转录因子的异二聚体相互作用：全基因组鉴定和比较分析” 的研究。
在这项研究中，研究人员结合了 Pfam 数据库中的蛋白质特征文件和植物特异性隐马尔可夫模型 (HMM) 来识别 bZIP 成员。结果，在黑树莓和红树莓中鉴定出了 49 个候选 bZIP 编码基因。这些基因被证实编码具有特征性基本区 (BR) 和亮氨酸拉链 (LZ) 结构域的蛋白质，长度从 137 到 706 个氨基酸不等，分子量从 15.9 到 76.3 kDa 不等。系统发育分析将它们分为 13 个系统发育分支，揭示了种间聚类，并表明进化保守性早于物种分化。此外，全基因组分析揭示了基因家族的显着扩张或收缩，基因重复，尤其是分散和片段重复，在悬钩子属bZIP基因的进化中发挥着至关重要的作用。对十个蔷薇科物种的比较基因组分析表明，玫瑰、覆盆子和草莓之间有更密切的进化关系，并确定悬钩子 基因组正在经历像野草莓一样的染色体重排。
RobZIP基因在不同组织中的基因本体注释和表达分析 强调了它们参与广泛的细胞过程，包括氮代谢和应激反应。该研究还深入研究了已鉴定的 bZIP 的二聚特性，预测潜在的蛋白质相互作用，并通过酵母双杂交测定对其进行验证。总体而言，这项研究不仅提供了对悬钩子中 bZIP 转录因子的功能冗余和特定作用的见解 ，而且还强调了在蔷薇科家族中塑造其多样性的进化动态。总体而言，可能由于严格的选择标准，这项研究为bZIP基因家族对悬钩子 属内外调控网络的贡献提供了基础了解 ，为未来研究其功能机制和相互作用铺平了道路。
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